Реализуется по модели «два диплома». Программа обеспечивает глубокую подготовку в области оптимизационных, теоретико-вероятностных, эконометрических, теоретико-игровых методов. Математическая подготовка выпускников открывает широкие возможности для продолжения научной деятельности. Программа реализуется по модели двух дипломов с Европейским Университетом Виадрина (Германия).
Экономика — одно из самых популярных направлений магистратуры. На этой программе вузы готовят специалистов по финансам, аналитиков, бухгалтеров, аудиторов, банковских менеджеров, специалистов по налогам, по мировой экономике и ВЭД. Сфера интересов выпускника зависит от выбранного профиля обучения.